Submerso é um jogo livre de combate em terceira pessoa no qual você explora uma misteriosa cidade inundada e descobre a beleza da desolação em vastos ambientes ao ar livre. Você assume o papel de Miku, uma jovem que trouxe seu irmão ferido para a cidade em seu pequeno barco de pesca. Navegue pelas ruas inundadas da cidade de barco, escale os edifícios afogados e use seu telescópio para vasculhar a cidade em busca dos suprimentos necessários para salvar seu irmão moribundo. Ao explorar a cidade no seu próprio ritmo, você encontra o habitat que floresce neste lugar colorido e descobre objetos escondidos que reúnem a história de um mundo quebrado e uma família quebrada.

Submerso é uma aventura de exploração pacífica e livre de combate, ambientada em um futuro distópico onde a elevação dos mares afogou o mundo, deixando apenas os edifícios mais altos de uma cidade outrora grande se projetando do oceano sem fim. A história segue uma jovem chamada Miku e seu irmão mais novo gravemente ferido, Taku, que entram nessas ruínas inundadas depois de fugir de uma casa problemática. Sozinho e desesperado para salvar Taku, Miku se refugia no topo de uma torre de relógio imponente e atravessa a paisagem urbana submersa em um pequeno barco motorizado. Sua missão é simples, mas urgente: encontrar os suprimentos de que precisa para tratar as feridas de seu irmão. Guiada apenas por sua inteligência, ela rema entre as torres meio submersas, escalando fachadas desmoronadas para alcançar caixas de alívio deixadas para trás durante a crise. Enquanto ela junta fragmentos do que aconteceu com este lugar, Miku se aprofunda no mundo misterioso e encharcado na esperança de manter seu irmão vivo.