Bem-vindo a um novo mundo de Danganronpa e prepare-se para o maior e mais emocionante episódio de todos os tempos. Situado em um ambiente "psicopata", um novo elenco de 16 personagens se vê sequestrado e preso em uma escola. Dentro, alguns vão matar, alguns vão morrer, e alguns serão punidos. Reimagine o que você achava que era uma investigação de alto risco e ritmo acelerado enquanto investiga casos de assassinato distorcidos e condena seus novos amigos à morte.

A estudante do ensino médio Kaede Akamatsu é sequestrada e acorda para se encontrar presa dentro das paredes sinistras da Academia Suprema para Jovens Superdotados, ao lado de quinze outros estudantes cativos, entre eles o reservado Shuichi Saihara. Depois que um dispositivo misterioso restaura suas memórias, cada adolescente se lembra de possuir um extraordinário talento "Ultimate", com Kaede revelado como o Pianista Ultimate e Shuichi como o Detetive Ultimate. Sua confusão se transforma em pavor quando um urso robótico ameaçador chamado Monokuma aparece e anuncia as regras cruéis de um jogo mortal de matar: a única maneira de qualquer um deles escapar da academia é assassinar um colega e evitar ser exposto como o culpado em um julgamento de classe. Recusando-se a princípio, os alunos logo se veem empurrados para o desespero à medida que a armadilha se aperta ao seu redor.