Katana Zero é um jogo de plataformas de ação neo-noir de ritmo acelerado, com foco em combates acrobáticos de morte instantânea e uma estética neon escura dos anos 80. Ajudado por sua fiel katana, a droga de manipulação do tempo Chronos e o resto do arsenal de seu assassino, lute por uma cidade fragmentada e recupere o que é seu por direito.

Em uma metrópole encharcada de chuva e iluminada por néon, ainda marcada pela guerra, o Sujeito Zero é um assassino empunhando uma katana que pode desacelerar o tempo e vislumbrar momentos antes que eles aconteçam. Atormentado por amnésia e pesadelos assombrosos, ele realiza assassinatos contratados transmitidos por seu enigmático psiquiatra, que também atua como seu manipulador e fornece a droga misteriosa que alimenta suas habilidades. Enquanto Zero junta fragmentos de seu passado esquecido, ele cruza o caminho de uma jovem em seu prédio, um espadachim rival e outras figuras perigosas, cada vez mais certo de que as pessoas que dirigem suas mortes estão escondendo a verdade dele.