City of Heroes: Going Rogue foi lançado em 2010. Ao contrário de City of Villains, Going Rogue era uma expansão em vez de um Stand Alone e exigia o (s) jogo(s) original (is) para jogar. Going Rogue adicionou um sistema de Alinhamento, que permitia aos jogadores mudar de Herói para Vilão e adicionou dois Alinhamentos intermediários: Vigilante, à medida que o jogador progride de Herói para Vilão, e Rogue, à medida que o jogador progride de Vilão para Herói. Os jogadores com personagens Vigilantes ou Ladinos tinham acesso à Cidade dos Heróis de Paragon City e à Cidade dos Vilões de Rogue Isles até que mudassem para Herói ou Vilão. A expansão também adicionou a dimensão Terra Pretoriana, onde os jogadores poderiam começar como Pretorianos alinhados de forma neutra (escolhendo qualquer um dos dez Arquétipos básicos disponíveis para Heróis ou Vilões), decidindo ficar do lado da facção governante do Imperador Cole e se tornar um Lealista ou do lado do Resistência; a fidelidade pode mudar à medida que o jogador escolhe e completa as missões. Os jogadores pretorianos também poderiam atacar novas multidões neutras e, eventualmente, seriam capazes de jogar uma missão que lhes permitisse escolher ser um herói ou vilão e completar a jogabilidade nos jogos originais. Going Rogue também concedeu acesso a quatro novos conjuntos de poder, novos conjuntos de trajes e auras, e introduziu missões que começaram depois de derrotar multidões que afetavam o Alinhamento do jogador.