TimeSplitters 2 é um jogo de tiro em primeira pessoa que exige que os jogadores matem inimigos e completem objetivos usando uma variedade de armas e táticas em diferentes cenários predefinidos. Barras de armadura e saúde nas laterais da tela abaixam quando o jogador é baleado, o que pode ser aumentado passando por cima de coletes e kits médicos.

O jogo começa no ano 2401, quando o sargento Cortez e o cabo Hart são enviados para uma estação espacial infestada de TimeSplitter, onde um portal do tempo está sendo construído. Seu objetivo é recuperar os Cristais do Tempo. No entanto, antes que eles possam alcançá-los, os TimeSplitters os levam a diferentes períodos de tempo do passado. Eles devem ser seguidos e os cristais do tempo recuperados.