A Federação Galáctica está treinando novos recrutas. Usando os dados ambientais e de inimigos de Samus de várias missões, um grupo de elite de engenheiros criou o Projeto de Confronto: um revolucionário programa de treinamento em realidade virtual. Como sua cooperação era essencial para o projeto, ela foi escolhida para ser a primeira pessoa a experimentá-lo. Agora ela deve enfrentar os fantasmas de seu passado na derradeira missão de treinamento. Metroid: Confrontation é um pequeno jogo completo, ambientado no universo de Metroid. Começou como uma pequena demonstração tecnológica, usada para mostrar as capacidades do motor. Ele evoluiu lentamente para o que é hoje: uma aventura Metroid pequena, mas cheia de ação, com 3 lutas épicas contra chefes e muitos segredos.

A Federação Galáctica está treinando novos recrutas. Usando os dados ambientais e de inimigos de Samus de várias missões, um grupo de elite de engenheiros criou o Projeto de Confronto: um revolucionário programa de treinamento em realidade virtual. Como sua cooperação era essencial para o projeto, ela foi escolhida para ser a primeira pessoa a experimentá-lo. Agora ela deve enfrentar os fantasmas de seu passado na derradeira missão de treinamento.