Anthem é um RPG de ação de mundo compartilhado, onde os jogadores podem mergulhar em uma vasta paisagem repleta de tecnologia incrível e tesouros esquecidos. Este é um mundo onde os Freelancers são chamados para derrotar bestas selvagens, saqueadores implacáveis e forças que conspiram para conquistar a humanidade.

Um famoso Freelancer chamado Haluk reúne um exército de Freelancers para entrar no Coração da Fúria e desativar o Cenotáfio. Entre eles está o personagem sem nome do jogador, um novato realizando sua primeira missão. Acompanhando-os está Faye, a própria esposa de Haluk e Cypher. Logo após a missão, todos os outros Freelancers são mortos, levando Faye a convocar uma retirada, com o jogador evacuando um Haluk ferido. O fracasso retumbante faz com que as pessoas percam a fé nos Freelancers, cujas fileiras agora estão dizimadas. Dois anos depois, o jogador se estabeleceu em Fort Tarsis, uma cidade fronteiriça entre The Heart of Rage e Antium, a capital de Bastion. Em parceria com um jovem Cypher chamado Owen, eles ganham a vida concluindo modestos contratos de freelancer para os moradores locais. Owen aspira a ser um Freelancer, apesar de suas habilidades psíquicas serem um obstáculo para pilotar um Dardo. Um agente de Corvus chamado Tassyn contrata o jogador para localizar um espião que desapareceu enquanto estava disfarçado com uma gangue de contrabando chamada Regulators. Em um esconderijo devastado do Regulador, eles encontram um líder do Domínio chamado O Monitor. O Monitor é uma poderosa Cifra, um habilidoso piloto de Dardo, e participou do ataque a Marca Livre que criou o Coração da Fúria. O Monitor executa o espião de Tassyn e pega uma relíquia do Modelador que eles estavam escondendo. Tassyn supõe que o Domínio está coletando relíquias para outra tentativa de alcançar o Cenotáfio, e recontrata o jogador para alcançar o Cenotáfio primeiro. Ela também observa que Haluk e Faye passaram os últimos dois anos desenvolvendo um novo plano para desativar o Cenotaph, recrutando a dupla para a missão de Tassyn. Faye e Haluk acreditam que o único Dardo capaz de sobreviver ao Coração da Raiva é o lendário Dardo do Amanhecer da General Tarsis. Usando pistas encontradas nos túmulos dos Legionários de Tarsis, eles localizam o túmulo secreto de Tarsis. Dentro de seu túmulo, o jogador obtém o sinete de Taris, que atua como uma chave para a Fortaleza do Amanhecer - o local da última resistência de Tarsis e o lugar de descanso do Dardo do Amanhecer. No Templo do Amanhecer, o jogador é desafiado por testes de habilidade e determinação. Depois de reviver a última resistência de Tarsis, uma aparição da General Tarsis declara que o jogador possui as qualidades de um Legionário do Amanhecer e concede acesso ao seu Dardo. Antes que o jogador possa tomar posse do Dardo do Amanhecer, seu próprio Dardo congela. Owen aparece e assume o crédito por sabotar seu Dardo para que ele possa tomar o Dardo do Amanhecer para si mesmo. Ele planeja aceitar a oferta do Monitor de poupar o Forte Tarsis em troca de ajudá-lo com o Dardo do Amanhecer, e acusa o jogador de mantê-lo longe de seu sonho de ser um Freelancer. Antes de Owen sair no Dardo do Amanhecer, Faye examina seu módulo de blindagem exclusivo, o Escudo do Amanhecer, esperando que ele possa ser duplicado para que o jogador possa entrar no Coração da Raiva com seu próprio Dardo. Haluk e Faye conseguem construir uma cópia do Escudo do Amanhecer, mas são incapazes de ativá-lo. Ao mesmo tempo, Tassyn chega para anunciar que o Domínio está se aproximando do Coração da Fúria. Tassyn também revela que contratou o jogador a pedido da própria Faye para substituir o papel de Haluk como piloto do Dardo. Chateado, Haluk voa seu Dardo para a Fortaleza do Amanhecer para encontrar uma maneira de ativar o Escudo do Amanhecer, mas é emboscado pelo Domínio. O jogador chega e descobre que Haluk foi salvo por Owen, que pede desculpas por sua traição. Como uma oferta de paz, Owen desiste de seu próprio Escudo do Amanhecer antes de partir. Depois de ativar o Escudo do Amanhecer em seu Dardo, o jogador retorna ao Coração da Fúria, com Faye e Haluk fornecendo suporte remoto. O jogador descobre que o Monitor usou o conduíte para se fundir com o Hino e é forçado a lutar contra ele. Depois que o Monitor morre, Faye usa seus poderes para desativar o Cenotáfio e fechar o Coração da Fúria. Enquanto comemora em Fort Tarsis, o jogador é puxado por Tassyn para ver o cadáver de um Urgoth recentemente descoberto e morto dentro das fronteiras de Bastion. Suspeitando de outra crise, o jogador é convidado a estar pronto para ajudar novamente.