Lançado em conjunto com versões 3D nos consoles, a aventura do Pato Donald no Game Boy Color é um tradicional jogo de plataforma de rolagem lateral. O mago maligno Merlock sequestrou a repórter do Duckburg Times, Daisy Duck. O Pato Donald pede ajuda a Gyro Gearloose, que sugere usar sua mais recente invenção: um poderoso teletransportador. Infelizmente, Merlock descobre seus planos e rouba as plantas do dispositivo. Agora Gyro usa a máquina inacabada para teletransportar Donald para vários locais, onde ele deve encontrar as partes das plantas, para que ele possa confrontar Merlock e resgatar Daisy.