Wild Arms XF é um jogo de RPG tático 2D baseado em turnos, criando uma experiência de jogo em algum lugar entre Dungeons & Dragons e xadrez. Os jogadores recebem o controle de um pequeno esquadrão de personagens (seis ou menos) e colocados em um mapa baseado em grade que se assemelha a uma localização geográfica (um pântano, uma cidade, um rio), sobre o qual eles lutam batalhas para progredir no jogo. Como na maioria dos T/RPGs, a vantagem posicional pode ser crítica para a vitória, e os jogadores são encorajados a manobrar mais que seus inimigos, bem como superá-los. O jogo enfatiza o posicionamento e as manobras pela inclusão de "Artes de Formação", que aumentam o dano de ataque quando um inimigo está cercado por seus personagens em uma linha, um triângulo ou um círculo. Wild Arms XF é um membro da pequena subseção de T/RPGs cujos campos de batalha são baseados em peças hexagonais em vez de quadrados. "Artes de Combinação" retornam de títulos Wild ARMs anteriores, permitindo que os personagens ataquem um inimigo em estado de espera e, em seguida, entreguem seus ataques simultaneamente com o próximo aliado para atacar seu alvo. Se o jogador conseguir executar uma série ininterrupta de comandos, o dano infligido aos inimigos aumentará significativamente. Por outro lado, o inimigo obtém a mesma vantagem.

A história do jogo gira em torno de um grupo de cavaleiros chamado Chevalet Blanc e como a protagonista e seus cavaleiros retomam o reino de Elesius, que está sendo controlado pelo Conselho de Estadistas Anciões. A Princesa Real do reino morreu em um acidente, e o rei está doente demais para governar, o que provocou a ascensão do conselho. Como outros títulos de Armas Selvagens, isso ocorre no planeta moribundo Filgaia, desta vez onde os recursos naturais, alimentos, terras e ativos financeiros restantes estão no centro de contínuos confrontos armados. Apesar disso, Elasius é um dos poucos lugares pacíficos em Filgaia. As origens de Chevalet Blanc são tudo menos nobres: dois Drifters, Clarissa Arwin e seu irmão adotivo Felius, chegam ao reino de Elesius em busca de um Drifter chamado Rupert Dandridge, que há cinco anos matou a mãe de Clarissa, a arqueóloga itinerante Melissa Arwin, e tirou dela o espada poderosa "Iskender Bey". A missão de Clarissa é apenas recuperar essa espada, mas antes que muito tempo se passe, ela foi confundida com Alexia Lynn Elesius, a herdeira presuntiva do trono de Elesius que morreu há um ano em circunstâncias misteriosas. Embora o governo do conselho seja geralmente egocêntrico, sua presença mais constante em Elasius assume a forma da "Guarda Marcial", uma força mercenária de "manutenção da paz" que rouba e oprime impunemente. Para reunir os cidadãos de Elasius, Clarissa se declara publicamente como Alexia e funda um movimento rebelde chamado "Chevalet Blanc", em homenagem aos Cavaleiros Fundadores de Elasius. Seu objetivo estabelecido é defender os cidadãos da nação, o que envolverá derrotar o conselho. O fato de Rupert ser o líder da Guarda Marcial só fortalece a determinação de Clarissa.