The Legend of Zelda: Skyward Sword é o primeiro jogo Zelda criado especificamente com o Wii em mente. O jogo faz uso do periférico Wii MotionPlus para luta de espadas, com um sistema de apontamento Wii Remote revisado usado para segmentação. Skyward Sword é estruturado de forma muito semelhante aos jogos Zelda anteriores, enquanto você viaja por um mundo superior em busca de templos para visitar e, uma vez dentro, resolve uma série de quebra-cabeças antes de lutar contra um chefe no final e receber a próxima parcela do enredo. A maior mudança é que o mundo superior está mais focado em quebra-cabeças com apenas um punhado de ação.

Na comunidade flutuante da ilha de Skyloft, um jovem cavaleiro em treinamento chamado Link vive acima de um mar interminável de nuvens, sem saber do mundo da superfície abaixo. Quando sua amiga de infância Zelda é arrastada por um misterioso tornado escuro e puxada para baixo da barreira das nuvens, Link é atraído para uma espada sagrada escondida dentro de uma estátua da deusa. O espírito da lâmina, Fi, revela que Link é o herói profetizado destinado a enfrentar um mal crescente. Ele deve descer às terras da superfície há muito abandonadas para encontrar Zelda antes que o autoproclamado Lorde Demônio Ghirahim possa usá-la para reviver seu mestre aprisionado, o antigo Rei Demônio Demise, cujo retorno ameaçaria toda a existência.