O Ninja Ryu está de volta para vingar a morte de seu pai e parar o Ashtar Maligno. Um ano se passou desde que Ryu enfrentou seu arqui-inimigo pela última vez, e ainda assim a atividade no fundo do reino das trevas continua. Ashtar, o senhor do mal que controla secretamente Jaquio, está novamente em movimento, e cabe a Ryu, o "Dragão Ninja", acabar com isso. Use todos os segredos do verdadeiro Ninjitsu, juntamente com os emocionantes efeitos especiais visuais e de áudio e seja atraído para o mundo de fantasia de Ninja Gaiden II: A Espada Negra do Caos.